Jika glansitis tidak diobati dengan terapi laser, infeksi patogenik perlu diidentifikasi dan diobati dengan obat yang relevan. Pertama, penting untuk mengklarifikasi apakah pasien menderita diabetes atau apakah ada kondisi di mana flora normal tubuh ditekan karena penggunaan agen antibakteri jangka panjang. Kedua, penyebab glansitis harus dianalisa lebih lanjut. Jika telah terjadi kontak seksual yang tidak bersih, mungkin ada infeksi gonokokus, mikoplasma, klamidia dan infeksi lainnya yang hadir sebagai akibatnya. Jika lebih banyak kotoran yang ada untuk waktu yang lama dan tidak ada perhatian untuk mencuci pribadi, glansitis mungkin disebabkan oleh faktor non-infeksius karena skala kulup. Hal ini juga dapat disebabkan oleh infeksi bakteri umum atau adanya infeksi seperti jamur atau trikomonas. Obat yang berbeda diperlukan untuk mengobati infeksi yang berbeda, seperti salep antibiotik untuk infeksi bakteri. Namun demikian, dalam kasus infeksi jamur, salep antibiotik tidak efektif dan diperlukan obat antijamur. Untuk infeksi trikomonas gabungan, metronidazol memiliki efek terapeutik tertentu, sementara obat lain tidak seefektif itu.