Bayi memiliki fungsi limpa dan lambung yang lemah dan sering menderita muntah dan diare karena pola makan dan alasan lainnya. Penyebab paling umum adalah gastroenteritis. Manifestasi klinisnya yang khas adalah diare, mual, muntah, dan sakit perut. Infeksi virus adalah penyebab paling umum dari gastroenteritis. Berbagai virus dapat menyebabkan gastroenteritis, yang paling umum adalah rotavirus, diikuti oleh norovirus, astrovirus, dan adenovirus enterik. Hal yang paling penting dalam mengobati gastroenteritis pada bayi adalah untuk mengisi kembali air dan elektrolit. Anak cukup beristirahat di tempat tidur dan minum air dalam jumlah yang cukup (misalnya, larutan garam rehidrasi oral), dan bahkan pasien yang muntah harus mencoba minum air sebanyak mungkin. Minuman berkarbonasi, teh, minuman olahraga, minuman berkafein, dan jus buah tidak cocok untuk rehidrasi. Rehidrasi intravena diperlukan jika anak mengalami muntah atau diare yang berkepanjangan atau jika terjadi dehidrasi berat. Antiemetik dapat ditambahkan jika muntahnya parah, atau jika diare berlangsung lebih lama dari 24 hingga 48 jam dan tidak ada tanda-tanda infeksi bakteri yang lebih serius. Antiemetik dan obat antidiare biasanya tidak direkomendasikan untuk anak-anak. Karena antibiotik dapat menyebabkan diare atau meningkatkan pertumbuhan bakteri yang kebal terhadap obat, antibiotik biasanya tidak dianjurkan meskipun organisme penyebab gastroenteritis telah diidentifikasi. Namun, antibiotik dapat digunakan untuk infeksi bakteri patogen tertentu (misalnya Campylobacter, Shigella, Vibrio cholerae, dll.) atau jika pasien mengalami diare akibat perjalanan. Antibiotik tidak efektif untuk gastroenteritis akibat infeksi virus. Gastroenteritis akibat infeksi parasit memerlukan obat antiparasit. Gastroenteritis pada anak-anak berkembang dengan cepat dan gangguan elektrolit merupakan masalah yang sangat berbahaya. Pemberian obat antiemetik dan antidiare secara mandiri pada umumnya tidak dianjurkan pada tahap awal.