Pengobatan kutil datar meliputi pengobatan topikal, injeksi obat, pengobatan oral, perawatan bedah, dan terapi fisik. 1. Pengobatan topikal: asam salisilat dapat memainkan peran terapeutik dengan mendorong pengelupasan epidermis, krim asam retinoat berperan melalui regulasi imunitas seluler dan regulasi proliferasi sel epitel, salep imiquimod dapat mengaktifkan sel imun untuk merangsang tubuh mengidentifikasi virus, krim interferon α-2b memiliki efek menghambat replikasi virus dan meningkatkan kekebalan seluler. 2. Suntikan obat: injeksi intradermal vitamin D3 efektif untuk beberapa lesi, injeksi intradermal bleomisin dapat membuat nekrosis jaringan lesi membentuk keropeng hitam dan berangsur-angsur rontok setelah beberapa minggu. 3. Obat oral: tidak ada obat anti-HPV yang akurat dan efektif, tetapi imunomodulator seperti interferon dan levamisol sering digunakan dalam praktik klinis. 4. Pembedahan: Pembedahan dapat dilakukan untuk mengangkat lesi kulit secara langsung. 5. Terapi fisik: laser CO2 yang umum digunakan, pembekuan nitrogen cair, terapi gelombang mikro, dan sarana perawatan terapi fisik lainnya.