Kista mulut dan maksilofasial dibagi menjadi dua kategori: kista jaringan lunak dan kista rahang.
Kista jaringan lunak meliputi kista sebasea, kista dermatomal atau kista seperti epidermis, kista saluran tiroglosal, kista celah insang, kista kelenjar mukosa, dan kista kelenjar sublingual.
Kista rahang yang kista rahang dibagi lagi menjadi kista odontogenik dan kista non-odontogenik.
Kista odontogenik: termasuk kista periapikal, kista primordial, dan kista yang mengandung gigi.
Kista non-gigi: termasuk kista maksila bulat, kista nasopalatine, dan kista median.