ISK dan vaginitis terkait karena pembukaan uretra dan pembukaan vagina sangat dekat satu sama lain pada wanita dan jika pasien memiliki ISK, hal itu juga dapat dengan mudah menyebabkan infeksi ginekologi vaginitis karena infeksi silang. Dan jika pasien dengan infeksi ginekologi jangka panjang, seperti vaginitis atau servisitis, tidak segera diobati, hal ini juga dapat menyebabkan ISK berulang dan sering atau sulit disembuhkan. Jika ISK dianggap sebagai infeksi anaerobik atau jamur, kemungkinan besar ISK disebabkan oleh persilangan infeksi ginekologi, seperti Candida vaginitis atau vaginitis dengan infeksi anaerobik, yang keduanya dapat menyebabkan ISK yang sesuai. Oleh karena itu, para wanita juga harus mengesampingkan infeksi ginekologi apa pun sewaktu mengobati ISK, dan jika mereka mengalaminya, mereka harus segera diobati.