Anak-anak harus divaksinasi HFMD antara usia enam bulan dan lima tahun setelah lahir, karena ini adalah usia ketika anak-anak rentan terhadap HFMD dan dapat menderita komplikasi serius. Anak-anak pada usia ini memiliki sistem kekebalan tubuh yang rendah dan tertular HFMD dapat menyebabkan komplikasi serius seperti oedema paru neurogenik dan miokarditis, dan bahkan dapat menyebabkan kematian. Vaksin HFMD terutama dikembangkan untuk enterovirus EV71, yang merupakan penyebab HFMD yang paling parah pada anak-anak, sedangkan coxsackievirus adalah penyebab HFMD yang paling ringan.