Atropin konsentrasi rendah memiliki efek samping dalam pengobatan miopia. Saat ini, atropin konsentrasi rendah secara bertahap menjadi obat lini pertama untuk pengendalian miopi pada remaja. Dibandingkan dengan atropin 0,5% konsentrasi sedang dan atropin 1% konsentrasi tinggi yang digunakan di masa lalu, atropin konsentrasi rendah dengan komposisi obat hanya 0,01% relatif lebih aman.
Namun, ada beberapa pasien yang telah menunjukkan efek samping ringan atau berat dengan atropin konsentrasi rendah. Ini termasuk penglihatan kabur, penurunan penglihatan, fotofobia, keringat berlebih, mata tersumbat, mulut kering dan tenggorokan kering.
Perlu dicatat bahwa atropin konsentrasi rendah hanya diindikasikan untuk pengobatan pseudomiopia dan tidak memiliki efek terapeutik pada miopia sejati. Ada juga beberapa pasien di klinik yang tidak memiliki efek kontrol yang signifikan bahkan dengan intervensi pengobatan atropin konsentrasi tinggi.