Amoksisilin masih efektif dalam pengobatan otitis media, tetapi penting untuk menggunakan obat secara khusus untuk setiap kasus. Amoksisilin, sebagai antibiotik, efektif baik pada otitis media sekretorik maupun otitis media supuratif. Namun, untuk otitis media sekretorik, di atas amoksisilin oral, dianjurkan untuk mengonsumsi beberapa obat oral yang meningkatkan penyerapan cairan dan hilangnya oedema mukosa, seperti softgels enterik serai kayu putih. Dalam kasus otitis media purulen, tetes telinga oxyfluoxacin topikal direkomendasikan di atas amoksisilin oral. Jika amoksisilin telah diterapkan untuk waktu yang lama, mungkin tepat untuk menggantinya dengan amoksisilin klavulanat kalium oral yang relatif lebih efektif, yang mungkin lebih efektif dibandingkan dengan amoksisilin.