Sumber infeksi utama leptospirosis adalah tikus dan babi, di antaranya tikus gipsi garis hitam adalah sumber infeksi utama yang menyebabkan leptospirosis tipe padi, dan leptospira dalam urin mereka dibuang ke sawah, dan petani mudah terinfeksi saat memanen padi. Dan babi karena kontak dekat dengan manusia, urin mereka juga mengandung sejumlah besar leptospirosis, dan babi memiliki jangka waktu ekskresi yang lama, sehingga dapat mencemari air, kandang babi basah dan berair, ada juga sejumlah besar leptospirosis di tanah dan air yang tergenang, hewan umum lainnya yang menyebabkan infeksi adalah anjing dan sapi. Sementara pasien leptospirosis juga dapat dikeluarkan melalui urin, tetapi karena urin manusia bersifat asam, dan tidak cocok untuk pertumbuhan leptospirosis. Selain itu, individu yang terinfeksi resesif juga dapat mengeluarkan bakteri, tetapi tingkat ekskresinya tidak tinggi, sehingga tidak mungkin manusia adalah sumber infeksi.