Kasus hipoksia serebral ringan dapat diobati dengan obat yang menyehatkan sel-sel otak, seperti gangliosida dan faktor pertumbuhan saraf tikus. Pada kasus yang parah, bayi perlu diobati dengan obat penutrisi sel otak dan, jika perlu, terapi oksigen hiperbarik atau terapi oksigen subkritis. Pada neonatus dengan hipoksia serebral, prognosis umumnya baik jika derajat hipoksia tidak terlalu parah dan tidak ada gejala sisa. Jika tingkat hipoksia lebih parah, kemungkinan tidak akan sembuh dengan sendirinya dan akan memerlukan obat untuk menyehatkan sel-sel otak, dan mungkin ada gejala sisa seperti keterbelakangan mental, epilepsi atau bahkan cerebral palsy.