Penyebab utama lesi materi putih otak adalah demielinasi imunodefisiensi, infeksi virus atau keracunan, dan beberapa lesi materi putih otak yang diturunkan. Untuk demielinasi imunodefisiensi, pengobatan utama adalah glukokortikoid, seperti metilprednisolon. Pengobatan utama adalah glukokortikoid, seperti metilprednisolon, atau imunomodulator, atau beta interferon, atau gammaglobulin. Dalam kasus infeksi virus, pengobatan utama adalah terapi antivirus, meskipun tidak ada obat khusus yang tersedia untuk virus. Dalam kasus lesi beracun, pengobatan juga diperlukan untuk menghilangkan racun. Namun demikian, dalam kasus lesi demielinasi yang diinduksi secara genetis, tidak ada obat untuk lesi materi putih. Untuk pengobatan penyakit ini, hal utama yang harus dilakukan adalah mendeteksi dan mengendalikan lesi materi putih di otak secara dini, kecuali faktor genetik.