CA125 juga dikenal sebagai antigen glycan 125, dan CA125 yang normal tidak cukup untuk menyingkirkan endometriosis. CA125 termasuk dalam jenis penanda tumor, pasien dengan kanker epitel ovarium, kanker tuba falopi, kanker endometrium, adenokarsinoma paru, adenokarsinoma saluran cerna, dan penyakit lainnya dapat melihat peningkatan indikator ini setelah pemeriksaan. Sebagian besar pasien dengan endometriosis mengalami peningkatan CA125 dan penanda tumor lainnya, namun, tidak semua pasien dengan endometriosis mengalami peningkatan CA125, beberapa pasien memiliki CA125 yang normal, dan sel endometriosis tidak selalu mengeluarkan CA125. Peningkatan CA125 memiliki sensitivitas dan spesifisitas yang rendah untuk mendiagnosis endometriosis dan tidak dapat digunakan sebagai kriteria diagnostik independen, dan CA125 yang normal tidak dapat sepenuhnya menyingkirkan endometriosis.