Jika tujuan tes darah adalah untuk menentukan agen mana yang bertanggung jawab atas HFMD, maka antibodi terhadap coxsackievirus grup A tipe 16 atau enterovirus 71 diindikasikan. Namun demikian, ada patogen lain yang menyebabkan HFMD yang tidak dapat sepenuhnya diidentifikasi dengan tes darah, dan virus-virus ini cenderung menyebabkan infeksi berbahaya, yaitu tidak ada gejala klinis atau hanya herpes sakit tenggorokan. Oleh karena itu, tidak mungkin untuk menentukan apakah seseorang menderita HFMD dengan mencari antibodi terhadap patogen ini, karena tanda-tanda klinis harus ada agar penyakit ini digambarkan sebagai HFMD. Jika tujuan tes ini adalah untuk menentukan tingkat keparahan HFMD, Anda dapat melihat jumlah sel darah putih, yang kemungkinan tinggi jika lebih besar dari 15 dalam 10^9 unit. Jika protein C-reaktif juga tinggi, hal ini dapat dikuatkan dari samping, sementara fungsi hati, enzim jantung dan fungsi ginjal digunakan untuk menentukan apakah ada kerusakan pada hati, ginjal atau otot jantung yang disebabkan oleh HFMD.