Penyakit batu ginjal memiliki berbagai gejala, di mana air seni berdarah dan mual hanya beberapa di antaranya, sementara rasa sakit dan muntah adalah salah satu gejala batu ginjal. Rentang gejala yang terkait dengan batu ginjal terkait dengan tingkat obstruksi, ukuran batu dan adanya infeksi sekunder. Lebih dari separuh penderita batu ginjal akan mengalami berbagai tingkat nyeri punggung, tergantung pada ukuran batu. Batu besar menyebabkan rasa sakit yang tumpul atau samar-samar, sementara batu kecil menyebabkan kolik, juga dikenal sebagai kolik ginjal. Kolik bisa berlangsung dari beberapa menit hingga beberapa jam dan bersifat paroksismal, dengan pasien mengalami mual dan muntah serta keringat yang menetes. Hematuria adalah gejala utama batu ginjal, tetapi biasanya sulit dideteksi dengan mata telanjang dan kebanyakan pasien memerlukan mikroskop untuk mengamatinya. Hematuria biasanya terjadi setelah berolahraga atau beraktivitas. Beberapa pasien dengan batu ginjal tidak mengalami rasa sakit atau hematuria dan keberadaan batu bisa sulit dideteksi tanpa pemeriksaan urologi lebih lanjut.