Proktitis kronis, jika ditangani secara agresif, biasanya tidak mempengaruhi harapan hidup pasien. Jika tidak dikontrol secara efektif, maka dapat mempengaruhi kualitas hidup pasien dan bahkan mengancam nyawa. Perjalanan penyakit proktitis kronis relatif panjang, dengan pengobatan lengkap biasanya tidak mempengaruhi harapan hidup pasien, umumnya dan orang normal bisa mendapatkan harapan hidup yang sama. Jika tidak diobati, perkembangan lebih lanjut dari penyakit ini tidak hanya mempengaruhi kualitas hidup pasien, tetapi juga dapat mengancam jiwa. Jika proktitis kronis disebabkan oleh infeksi bakteri, obat-obatan seperti levofloxacin, cefaclor dan montelukast dapat diberikan. Jika disebabkan oleh infeksi virus, gansiklovir, asiklovir dan bifidobakteri dapat diberikan. Proktitis kronis dianjurkan untuk berkonsultasi dengan dokter tepat waktu, dan ikuti petunjuk dokter untuk mengatur penggunaan obat.