Bayi dengan HFMD biasanya tidak mengalami batuk, tetapi biasanya mengalami batuk yang dianggap disebabkan oleh infeksi saluran pernapasan. Dalam hal ini, dianjurkan untuk pergi ke rumah sakit dan biarkan dokter mendengarkan batuk untuk melihat apakah ada bronkitis atau bronkopneumonia dan, jika perlu, lakukan rontgen dada untuk mengklarifikasi tingkat infeksi. Jika infeksinya ringan, pengobatan dukungan simtomatik seperti penekan batuk oral dapat diindikasikan. Jika infeksinya parah, mungkin perlu diobati dengan antibiotik oral atau antibiotik intravena untuk mengurangi peradangan, bersama dengan terapi inhalasi nebulisasi. Makan makanan ringan, hindari makanan pedas dan iritasi, dan tetap hangat untuk menghindari kedinginan. Hindari pergi ke tempat-tempat di mana orang berkumpul untuk mencegah infeksi silang.