Sakit kepala setelah bangun dari tidur dikaitkan dengan banyak faktor.
Dengan tidur yang terlalu sedikit atau kualitas tidur yang buruk, otak tidak mendapatkan istirahat yang cukup dan saraf otak tetap dalam keadaan tegang, sehingga bermanifestasi sebagai sakit kepala dan pusing setelah bangun dari tidur.
Tekanan darah tinggi, umumnya karena kontrol tekanan darah yang buruk, tekanan jangka panjang pada pembuluh darah, vasokonstriksi pagi hari volume darah otak meningkat yang disebabkan oleh sakit otak bagian belakang.
Tidur dengan pilek dan flu juga dapat menyebabkan sakit kepala saat bangun tidur.