Epididimitis kronis biasanya tidak mengancam jiwa, tetapi rasa sakit dan ketidaknyamanan kronis dan berulang dapat secara serius mempengaruhi kualitas hidup pasien. Epididimitis kronis diketahui menyebabkan penurunan kualitas sperma. Epididimitis kronis bilateral yang parah dapat menyebabkan obstruksi vas deferens, menyebabkan pasien mengalami azoospermia obstruktif, yang menyebabkan infertilitas pria.