Waktu pemulihan dari miokarditis akut sangat tergantung pada tingkat keparahan invasi jantung dan apakah pengobatan tepat waktu dan efektif. Untuk miokarditis akut ringan, dapat kembali normal setelah 2 hingga 4 minggu, tetapi olahraga berat harus dihindari setelah pemulihan dan dapat ditinjau kembali pada 1 bulan dan 3 bulan.
Pada sejumlah kecil pasien, kondisi ini dapat berkembang menjadi miokarditis kronis atau persisten dan waktu pemulihan dapat diperpanjang. Dalam kasus miokarditis fulminan, tingkat kematian dapat mencapai 80% pada fase akut, dan prognosis jangka panjang untuk pasien lebih baik setelah melewati fase risiko akut.