Pengobatan disentri toksik dibagi menjadi pengobatan simtomatik dan kausal, dengan pengobatan simtomatik termasuk pendinginan, biasanya fisik dan, jika perlu, farmakologis. Pengobatan allopathic mencakup penggunaan antibiotik yang tepat.
Untuk pasien syok, pengobatan utama adalah untuk memperluas volume darah dan memperbaiki asidosis dengan garam glukosa, memperbaiki gangguan mikrosirkulasi dan melindungi organ vital dengan obat vasoaktif dan antikoagulasi dengan heparin, dll. Untuk pasien serebral, manitol digunakan untuk mengurangi oedema serebral dan obat vasoaktif digunakan untuk memperbaiki mikrosirkulasi serebral, sementara kegagalan pernapasan dicegah dengan stimulan pernapasan atau ventilasi mekanis.
Pengobatan utama untuk penyebabnya adalah terapi antimikroba, terutama menggunakan sefalosporin generasi ketiga dan kuinolon.