Pencegahan disentri basiler toksik mencakup pengelolaan sumber infeksi, memotong jalur penularan dan melindungi populasi yang rentan.
Mengelola sumber infeksi terutama tentang mengelola dan merawat secara menyeluruh pasien dengan disentri akut dan kronis serta pembawa untuk mencegah mereka menyebarkan patogen.
Dalam hal memotong jalur penularan, tujuan utamanya adalah menjaga kebersihan yang baik, mencuci tangan secara teratur, memperhatikan kebersihan makanan dan pengendalian lalat untuk mengurangi vektor penularan.
Untuk perlindungan orang yang rentan, kekebalan saat ini ditetapkan di China dengan cara vaksinasi hidup oral, tetapi tidak ada perlindungan silang antara berbagai jenis Shigella, dan infeksi berulang atau berulang diinginkan.