Alergi dapat menyebabkan langit-langit mulut gatal karena ketika alergen bersentuhan dengan permukaan sel mast atau basofil di selaput lendir langit-langit mulut, alergen menyebabkan sel mast atau basofil mengalami degranulasi dan melepaskan histamin dalam jumlah besar dan mediator lain yang menstimulasi ujung saraf di selaput lendir langit-langit mulut untuk menghasilkan sensasi gatal.