Disarankan agar vaksinasi lainnya diberikan satu minggu setelah gejala HFMD benar-benar hilang. Vaksinasi kemungkinan akan menyebabkan beberapa ketidaknyamanan selama HFMD, seperti demam rendah umum, yang mungkin tumpang tindih dengan demam HFMD dan memperburuk gejala. Setelah gejala HFMD benar-benar hilang, umumnya vaksinasi tidak mungkin diulang. Namun demikian, biasanya disarankan untuk menunggu seminggu setelah gejalanya hilang, karena mungkin masih ada peradangan di beberapa bagian tubuh, atau mungkin masih ada kelainan dalam tes. Pada saat ini, peradangan telah hilang dan vaksinasi tidak akan tumpang tindih dengan gejala HFMD dan memperburuknya, bahkan jika ada reaksi yang merugikan.