Pengobatan faringitis folikuler terutama bersifat etiologis dan simtomatik.
Pengobatan etiologis adalah pengobatan utama untuk faringitis folikel dan meliputi: pengobatan aktif faringitis akut, rinitis, sinusitis atau penyakit lain yang memicu faringitis folikel; penghentian merokok dan alkohol, menghindari paparan debu, gas berbahaya, makanan pedas dan merangsang, dll.; dan peningkatan latihan fisik untuk memperkuat konstitusi seseorang.
Pengobatan simtomatik termasuk ablasi laser, elektrokoagulasi atau cryosurgery untuk mengobati folikel limfatik di dinding faring posterior, dan tablet faring oral untuk menghilangkan rasa sakit dan pengobatan anti-inflamasi.