Waktu penyembuhan HFMD perlu ditentukan oleh tingkat keparahan gejalanya. Dalam kasus HFMD ringan, biasanya tidak ada gejala prodromal yang jelas, terutama dalam bentuk ruam makulopapular atau herpes pada tangan, kaki, mulut dan bokong, dan gejalanya bisa mereda dalam waktu sekitar 5 hari tanpa meninggalkan bekas. Dalam kasus yang berat, meningitis aseptik, ensefalitis (ensefalitis batang otak yang paling parah) dan kelumpuhan tertunda akut dapat terjadi dalam 1-5 hari setelah onset dan kematian dapat terjadi dalam waktu singkat. HFMD adalah penyakit yang dapat sembuh dengan sendirinya, dengan sebagian besar anak-anak pulih dalam waktu 1 minggu dan ruamnya akan hilang dalam waktu 2 minggu. Pada kasus yang parah, dengan kerusakan kardiovaskular dan neurologis, diperlukan rawat inap dan dapat berlangsung hingga 1-2 bulan. Anak-anak dengan jenis HFMD yang umum dapat dirawat di unit infeksi atau klinik rawat jalan pediatrik. Orang tua terutama harus memperhatikan perawatan mulut dan ruam mereka dan mengamati suhu tubuh mereka untuk mengetahui faktor risiko apa pun yang dapat memperburuk penyakit, seperti mudah kaget saat tidur, anggota badan gemetar, dan suhu tinggi yang terus-menerus yang tidak mereda, maka diperlukan peringatan.