Kumpulan lengkap protein yang dibuat oleh suatu organisme. Protein dibuat dalam jumlah yang berbeda dan pada waktu yang berbeda, tergantung pada cara kerjanya, kapan dibutuhkan, dan bagaimana mereka berinteraksi dengan protein lain di dalam sel. Informasi tentang proteome dapat digunakan untuk membantu menemukan protein mana yang terlibat dalam penyakit, seperti kanker. Informasi ini juga dapat digunakan untuk membantu mengembangkan obat yang memblokir protein-protein ini.