Bakteri patogen yang paling umum pada umbilikulitis neonatal adalah Staphylococcus aureus, tetapi juga Staphylococcus epidermidis, Escherichia coli dan Klebsiella pneumoniae. Staphylococcus aureus resisten terhadap banyak antibiotik dan dapat menyebabkan sepsis pada infeksi yang parah; Escherichia coli dapat dengan mudah menyerang aliran darah dari tunggul pusar dan dapat dengan mudah menyebabkan sepsis. Oleh karena itu, infeksi pusar neonatal harus diobati dengan antibiotik sesegera mungkin, jika tidak, dapat menyebabkan sepsis, yang dapat mengancam jiwa.