Tonjolan skapula pada anak-anak umumnya disebabkan oleh kelainan genetik tertentu, seperti sindrom Marfan dan sindrom Parsonage-Turner (neuritis pleksus brakialis akut). Ada juga kelainan kongenital, seperti hipertelorisme kongenital dan skoliosis kongenital, yang bisa menyebabkan perkembangan tulang yang abnormal, sehingga mengakibatkan penonjolan skapula.