Kondiloma akuminatum dapat tumbuh di dalam anus. Kondiloma akuminatum terjadi terutama pada alat kelamin eksternal dan di daerah lembab selaput lendir kulit di sekitar anus. Pada pria, biasanya terjadi pada kelenjar, alur koronal, preputium, uretra, penis dan perineum, dan pada wanita, biasanya terjadi pada labia majora dan minora, pembukaan vagina, klitoris, vagina, leher rahim, perineum dan daerah perianal. Pada homoseksual, lesi terjadi di anus dan rektum dan, dalam beberapa kasus, di daerah di luar area anogenital, seperti mulut, ketiak, payudara dan celah-celah jari kaki. Lesi awalnya tunggal, multipel atau kelompok butiran kecil kemerahan dengan tekstur lembut dan ujung yang sedikit tajam, terkadang sangat kecil sehingga tidak dapat dibedakan oleh mata. Lesi dapat bertambah besar secara bertahap, berbentuk papila, kembang kol atau jagung, dan berwarna putih, merah muda atau hitam, dengan vesikel, mengalir, pecah, berdarah atau permukaan yang terinfeksi.