Efek samping utama cahaya biru untuk bayi baru lahir adalah demam, diare dan ruam kulit. Sebagian besar penyakit kuning pada bayi baru lahir bersifat fisiologis dan biasanya mereda dengan sendirinya tanpa perawatan khusus; namun, jika penyakit kuning melebihi tingkat tertentu, penyakit kuning ini dianggap sebagai penyakit kuning patologis dan memerlukan rawat inap segera. Jika bilirubin langsung anak meningkat, fototerapi dapat menyebabkan kulit tampak biru-merah. Jika bilirubin langsung anak meningkat, fototerapi dapat menyebabkan kulit tampak sianotik, yaitu bronkitis, dan fototerapi harus segera dihentikan. Oleh karena itu, sinar biru untuk penyakit kuning neonatal, yang rentan terhadap efek samping seperti demam, diare, dan ruam, merupakan cara yang relatif efektif dan aman untuk memperbaiki penyakit kuning.