Mata juling kongenital dapat didiagnosis dengan cara berikut ini: pertama, mata juling kongenital dengan riwayat persalinan yang terhambat, pembengkakan yang dapat diraba pada satu sisi leher beberapa hari setelah kelahiran atau beberapa hari setelah kelahiran, dan strip otot sternokleidomastoid yang kaku pada sisi yang terkena yang dapat diraba seiring dengan bertambahnya usia. Ada juga kelainan bentuk wajah, dengan kepala dan leher dimiringkan ke sisi yang terkena, wajah diputar ke sisi yang sehat dan dimiringkan ke belakang, dan rahang diputar ke sisi yang sehat. Wajah dan fitur wajah tidak simetris, sisi yang terkena dampak pendek, sisi yang sehat panjang dan bulat, garis tengah wajah cembung ke arah sisi yang sehat, garis yang menghubungkan dua celah mata tidak sejajar dengan garis yang menghubungkan sudut kiri dan kanan mulut, dan garis ekstensi memotong sisi yang terkena dampak, deformitas secara bertahap memburuk seiring bertambahnya usia. Kedua, gerakan dibatasi, dengan kepala dan leher berputar ke sisi yang terkena dan miring ke sisi yang sehat. Ketiga, radiografi tulang belakang servikal akan menunjukkan deformitas servikal seperti vertebra cuneiform, fusi vertebra asimetris, displasia vertebra dan kemiringan lateral vertebra.