Fokus pengapuran ginjal dapat disebabkan oleh endapan kalsium yang tidak normal di dalam ginjal, atau bisa juga batu ginjal. Biasanya, kalsium hanya disimpan ke dalam tulang, sehingga tulang tampak keras sehingga tulang dapat memiliki efek pendukung pada seluruh tubuh. Namun demikian, jika kalsium diendapkan secara tidak normal di dalam ginjal, maka akan muncul fokus kalsifikasi di dalam ginjal. Banyak fokus kalsifikasi ginjal yang sangat terkait dengan usia, misalnya, orang yang lebih tua jauh lebih mungkin menemukan fokus kalsifikasi ginjal daripada orang yang lebih muda. Beberapa fokus kalsifikasi di ginjal mungkin merupakan batu ginjal, terutama di bagian tengah ginjal, pelvis ginjal, yang perlu diobati secara aktif karena dapat menyebabkan pielonefritis berulang dan juga Batu ginjal dapat menyebabkan pielonefritis berulang, hidronefrosis, kerusakan parenkim ginjal, dll.