Urine berwarna biru dapat terlihat pada kolera, tifus, demam tifoid, serta hiperkalsemia primer dan keracunan vitamin D. Selain itu, urin berwarna biru ini dikaitkan dengan penggunaan obat-obatan tertentu, seperti penggunaan amfoterisin, biru metilen, merah nila, minyak delima, asam salisilat dapat muncul setelah penghentian obat tersebut dapat menghilang. Urine berwarna hijau terlihat pada urine yang berkembang biak Pseudomonas aeruginosa, atau urine bilirubin yang ditempatkan terlalu lama, oksidasi menjadi bilirubin terjadi. Urine berwarna hijau pucat juga dapat disebabkan karena banyak mengonsumsi obat anti inflamasi. Urine berwarna hitam relatif jarang terjadi, sering terjadi pada pasien hemolisis intravaskular akut, seperti pasien malaria falciparum, yang secara medis dikenal sebagai urine demam hitam, merupakan salah satu komplikasi paling serius dari malaria falciparum. Plasma pasien ini mengandung sejumlah besar oksigen bebas, hemoglobin dan methemoglobin, yang diekskresikan dalam urin dan menyebabkan urin berwarna merah tua atau hitam. Beberapa pasien lain yang mengkonsumsi levodopa, kresol, fenilhidrazin dan obat lain, juga akan menyebabkan air seni berwarna hitam, setelah menghentikan obat tersebut akan hilang.