Manifestasi klinis umum dari sinusitis anal adalah buang air besar yang tidak tuntas, pembengkakan, nyeri dan gatal-gatal pada anus.
1. Sinusitis kronis sering tanpa gejala atau gejala ringan.
2. Sinusitis anal fase akut sering dikaitkan dengan nyeri kanal anal, pembengkakan anal, dan sensasi kuat gerakan ke bawah. Rasa sakit meningkat selama buang air besar, sering bermanifestasi sebagai rasa sakit yang menusuk dan merobek, dan dalam kasus yang parah juga dapat menyebabkan rasa sakit di daerah lain yang berdekatan seperti bokong dan perineum. Hal ini juga dapat menyebabkan kurangnya buang air kecil. Hal ini juga dapat menyebabkan gatal-gatal pada kulit anus.