Cara terbaik untuk mengobati kutil adalah memilih metode pengobatan berdasarkan lokasi dan ukuran kutil untuk mencapai hasil terbaik dan mengurangi efek samping beracun. Pilihan pengobatan terbaik adalah kombinasi pengobatan dan fisioterapi, dan imunoterapi, yang secara signifikan dapat mengurangi tingkat kekambuhan. Penderita harus menghindari hubungan seksual dan memperhatikan kebersihan peralatan mandi, pakaian dalam dan pakaian dalam untuk menghindari infeksi tidak langsung. Metode pengobatan utama adalah terapi fisik, seperti laser, pembekuan dan elektrokauter, dan pembedahan untuk kutil besar. Aplikasi topikal imiquimod, phthalodinan rub, dikombinasikan dengan terapi fotodinamik Ira intra-urethral, lebih efektif.