Sebagian besar kasus tinja tidak teratur disebabkan oleh gangguan gastrointestinal seperti gastroenteritis atau dispepsia, dan sebagian besar gangguan ini dapat berangsur-angsur membaik dengan pengobatan simtomatik seperti penggantian cairan dan istirahat.
Ada juga beberapa kasus tinja tidak teratur kronis yang disebabkan oleh tumor jinak dan ganas pada saluran usus, penyakit sistemik seperti hipertiroidisme dan lupus eritematosus sistemik, yang dapat diobati lebih lanjut setelah berkonsultasi dengan bagian penyakit dalam untuk mengklarifikasi penyebabnya.