Kriptorkismus pediatrik memiliki kecenderungan genetik tertentu, dengan riwayat kriptorkismus dalam keluarga yang menghasilkan prevalensi sekitar 15 persen pada keturunannya. Kriptorkismus adalah kelainan bawaan dengan predisposisi genetik yang relatif jelas, dan perkembangan kriptorkismus berkaitan dengan testis itu sendiri dan faktor endokrin. Kriptorkismus terutama terjadi pada bayi prematur, bayi dengan berat lahir rendah, dan bayi laki-laki dengan riwayat kriptorkismus dalam keluarga. Janin yang lahir dari ibu yang memiliki kebiasaan buruk selama kehamilan, seperti merokok, minum minuman keras, dan penyalahgunaan narkoba, juga rentan terhadap kriptorkismus. Saat ini, insiden kriptorkismus meningkat dari tahun ke tahun dan merupakan salah satu penyebab utama infertilitas pria. Sebagian besar anak dengan kriptorkismus bersifat unilateral dan beberapa kriptorkismus bersifat bilateral.