Komplikasi yang paling fatal dari sindrom Marfan adalah komplikasi kardiovaskular, yang meliputi aneurisma aorta dan koarktasio aorta. Mayoritas pasien mengalami dilatasi progresif aorta yang mengakibatkan penutupan katup aorta yang tidak sempurna, diikuti oleh aneurisma koarktasio yang disebabkan oleh degenerasi lapisan tengah aorta; pecahnya aneurisma ini adalah penyebab utama kematian dini.