Sebagian besar neonatus dengan hipoglikemia tidak memiliki gejala klinis yang khas dan biasanya muncul terutama dengan depresi, kesulitan menyusu, menangis, mudah tersinggung, dan kejang-kejang.
Hipoglikemia neonatal sebagian besar tidak bergejala, dan beberapa kasus yang bergejala dapat menunjukkan depresi, lesu, kesulitan menyusu, hipotonia, apnea, sianosis paroksismal, atau lekas marah, tremor dan kejang.
Karena manifestasi klinis hipoglikemia neonatal tidak khas, diagnosis terutama bergantung pada pemantauan glukosa darah, dan pemantauan glukosa darah harus dilakukan pada neonatus yang cenderung mengalami hipoglikemia dan mereka yang telah mengalami hipoglikemia hingga glukosa darahnya stabil.
Secara klinis, ketika bayi baru lahir mengalami gejala-gejala di atas, mereka harus berkonsultasi dengan dokter secara tepat waktu, di bawah bimbingan dokter profesional untuk mengklarifikasi penyebab penyakit, dan memilih metode pengobatan yang ditargetkan.