Apakah hipoglikemia neonatal dapat disembuhkan berkaitan erat dengan penyebab penyakit dan apakah ada kerusakan otak. Jika hipoglikemia neonatal disebabkan oleh penundaan menyusui, dll., sebagian besar dapat disembuhkan setelah perawatan. Beberapa penyakit metabolik genetik atau kerusakan otak memerlukan pengobatan jangka panjang. Hipoglikemia sementara pada bayi baru lahir disebabkan oleh penundaan pemberian ASI, asupan glukosa yang tidak mencukupi, asfiksia, sklerodaktili neonatal, dan penyakit serius lainnya. Hipoglikemia jenis ini dapat disembuhkan dengan suplementasi glukosa dan pengobatan penyakit utama. Beberapa penyakit metabolik yang diturunkan seperti galaktosemia neonatal dan penyakit penyimpanan glikogen, serta penyakit endokrin seperti hipoplasia hipofisis kongenital dan defisiensi hormon pertumbuhan, dll. Hipoglikemia yang disebabkan oleh penyakit-penyakit tersebut membutuhkan pengobatan jangka panjang, dan apakah dapat disembuhkan atau tidak, juga berkaitan dengan penyakit utamanya. Beberapa anak dapat sembuh dari hipoglikemia setelah mengendalikan penyakitnya, sementara beberapa anak dengan penyakit yang sulit disembuhkan akan mengalami hipoglikemia berulang. Terlepas dari penyebabnya, hipoglikemia yang sering dan berulang, dengan atau tanpa gejala, dapat menyebabkan kerusakan sel otak, dan sering kali meninggalkan gejala sisa seperti kecacatan intelektual, kecacatan motorik, kecacatan fungsional, dll., yang memerlukan perawatan jangka panjang. Begitu hipoglikemia terjadi pada bayi baru lahir, maka perlu segera mendapatkan perawatan medis untuk menghindari kerusakan sel otak bayi.