Nyeri vagina dapat disebabkan oleh berbagai faktor, seperti peradangan lokal pada vagina, cedera pada vulva atau vagina, kekurangan estrogen, dan konsep hubungan seksual yang tidak rasional. Cedera pada vulva dan vagina sebagian besar terjadi selama persalinan, tetapi juga karena trauma langsung, hubungan seksual, dan cedera yang disebabkan oleh obat-obatan. Hubungan seksual yang menyakitkan dapat disebabkan oleh lesi organik, tetapi lebih sering disebabkan oleh faktor psikologis.