Terdapat banyak penanda tumor pada saluran cerna, terutama termasuk carcinoembryonic antigen CEA dan glycan antigen CA.
Carcinoembryonic antigen CEA terdapat pada semua tumor ganas yang berasal dari endodermal. Untuk tumor saluran cerna, nilai yang meningkat terutama terlihat pada kanker lambung dan kolorektal, dan nilai spesifiknya dapat secara tepat merefleksikan kondisi tersebut. Untuk tumor stadium lanjut dengan metastasis jauh dan adenokarsinoma, nilai CEA relatif tinggi dan kondisinya relatif serius.
Glycoantigen terutama mencakup CA125, CA199 dan CA99 (CA125 mirip dengan CA199), yang merupakan sejenis molekul glikolipid yang terletak di membran sel tumor, dan nilainya yang tinggi relatif lebih berharga untuk diagnosis kanker lambung, kanker usus besar, dan kanker rektum.
Penanda tumor ini dapat digunakan sebagai salah satu indikator untuk mengevaluasi keberhasilan pengobatan, dan jika pengobatan klinis tumor gastrointestinal efektif, kadar serum penanda tumor ini akan menunjukkan penurunan yang signifikan. Jika penanda tumor serum ini meningkat secara signifikan pada saat tindak lanjut, ada kemungkinan tumor telah kambuh atau bermetastasis.
Perlu dicatat bahwa penanda tumor hanya merupakan indikator tambahan untuk diagnosis dan penilaian pengobatan tumor, dan diagnosis tumor perlu didasarkan pada pemeriksaan histopatologi.