Lipoma sistemik termasuk dalam lipoma multipel, yang biasanya berukuran kecil dan sering kali simetris. Lipoma yang terletak di bagian tubuh yang lebih dalam rentan terhadap perubahan ganas, dan harus diangkat tepat waktu, dan metode pembedahan yang umum digunakan adalah lumpektomi permukaan. Lumpektomi permukaan adalah operasi klinis yang umum dilakukan, yang dapat dilakukan di klinik rawat jalan. Anestesi yang digunakan adalah anestesi infiltrasi lokal, biasanya digunakan anestesi infiltrasi lidokain 2% untuk jaringan di sekitar lipoma, diikuti dengan eksisi lengkap lipoma dan pinggirannya, eksisi lengkap pinggirannya dapat mencegah kambuhnya lipoma, diikuti dengan penutupan jahitan pada sayatan, perban yang tepat, penggantian obat secara teratur dan pelepasan jahitan, dan kemudian dapat dilakukan. Sedangkan untuk lipoma yang berada jauh di dalam jeroan atau otot, perlu dilakukan sayatan pada kulit dan jaringan subkutan di lokasi lipoma hingga lipoma terpapar untuk dieksisi, dan kadang-kadang dapat dieksisi dengan bedah invasif minimal endoskopi.