Gastroenteritis akibat disfungsi usus sering kali bervariasi dari orang ke orang, dengan beberapa pasien yang bermanifestasi terutama sebagai mual dan muntah, yang lain sebagai refluks asam dan mulas, dan beberapa pasien dapat mengalami konstipasi atau memiliki tinja yang tidak berbentuk serta diare. Rencana pengobatan dan prinsip-prinsip pengobatan pasti berbeda untuk berbagai jenis gastritis dan gastroenteritis. Jika manifestasi utama pasien adalah refluks asam, nyeri ulu hati, mual dan muntah, obat oral untuk menekan sekresi asam dan meningkatkan motilitas gastrointestinal terutama diperlukan. Jika pasien dimanifestasikan oleh tinja yang tidak berbentuk, diare dan sakit perut, ia harus minum obat anti-diare oral, serta obat yang menghambat sekresi gastrointestinal dan menghambat motilitas gastrointestinal, dan probiotik yang mengatur flora usus, untuk mengobati gejalanya dengan lebih baik.