Metode yang paling efektif untuk mengobati fisura ani adalah eksisi bedah. Waktu pemulihan setelah pembedahan tergantung pada tingkat keparahan fisura dan konstitusi pasien sendiri, dan tidak dapat digeneralisasikan. Pembedahan invasif minimal untuk fisura ani biasanya dilakukan pada sfingter ani internal. Jika gejala pasien ringan dan sayatan kurang dari 1cm, pasien akan berangsur-angsur membaik dan rasa sakitnya akan berkurang dalam 1-2 minggu setelah pembedahan. Namun, karena tingginya tingkat bakteri perianal dan stimulasi buang air besar setiap hari, waktu penyembuhan bisa tertunda dan mungkin diperlukan waktu sekitar 1 bulan agar luka pulih sepenuhnya. Jika fisura lebih parah, lesi lebih dalam dan sayatan bedah lebih besar dari 1cm, pasien akan pulih lebih lambat dan biasanya membutuhkan waktu sekitar 1 bulan agar rasa sakitnya berkurang. Namun demikian, berapa lama waktu yang diperlukan untuk pulih, tergantung pada kemampuan pemulihan pasien sendiri dan perawatan pasca-operasi, yang bisa memakan waktu hingga beberapa bulan. Pasien disarankan untuk mengatur pola makan setelah operasi, tidak makan berlebihan, tidak minum alkohol, tidak makan makanan pedas dan merangsang, dan makan lebih banyak sayuran dan buah-buahan yang kaya serat untuk menghindari atau mengurangi sembelit; pada saat yang sama, perhatikan kebersihan perianal, dan gunakan air hangat atau larutan kalium permanganat untuk mandi setelah buang air besar untuk mendorong pemulihan luka secepat mungkin.