Gigi bungsu yang tidak terlihat mengacu pada gigi bungsu yang terkubur dan terhalang. Jenis gigi bungsu ini terkubur begitu dalam di tulang rahang sehingga tidak ada jejaknya yang terlihat di mulut. Pertanyaan apakah gigi bungsu jenis ini perlu dicabut harus dianalisis berdasarkan kasus per kasus. Jika gigi bungsu tumbuh secara horizontal atau miring dan sangat dekat dengan gigi molar ke-2 di depan, disarankan untuk mencabutnya. Gigi bungsu akan memiliki kecenderungan untuk tumbuh ke depan, menyebabkan pembusukan atau bahkan kehilangan gigi molar ke-2 anterior. Namun, jika gigi bungsu sangat dalam dan jauh dari molar ke-2 anterior, dan terutama dekat dengan kanal alveolar inferior, ada risiko tinggi kerusakan saraf selama ekstraksi. Dalam hal ini, dimungkinkan untuk menjaga gigi di bawah pengamatan klinis. Namun demikian, disarankan juga untuk mengambil radiografi tahunan gigi bungsu untuk memeriksa apakah gigi tersebut memiliki kecenderungan untuk erupsi atau tumbuh ke depan, atau apakah gigi tersebut dapat membentuk kista yang mengandung gigi, dan untuk mencabutnya sesegera mungkin jika ditemukan kelainan.