Ada banyak jenis obat untuk mengobati IBS: pertama, obat untuk penekanan asam, yang biasa digunakan secara klinis adalah H2 receptor blocker dan PPI inhibitor, yang pertama adalah Famotidine dan Ranitidine, yang kedua adalah Omeprazole dan Pantoprazole. Kedua, obat untuk mengatur flora usus, seperti kapsul Bifidobacterium typhimurium 2 kapsul 1 kali, 2-3 kali sehari. Ketiga, obat-obatan untuk melindungi mukosa lambung, misalnya Healing New Liquid 1 kali 10ml, 3 kali sehari. Tablet magnesium aluminium karbonat, 2 tablet sekali, 3 kali sehari, dikunyah setelah makan. Keempat, obat anti inflamasi, seperti kapsul norfloksasin, 2 kapsul 1 kali, 2 kali sehari. Montelukast 1 kali 3g, 2-3 kali sehari melalui mulut. Pengobatan gastroenteritis umumnya memerlukan pemahaman yang jelas tentang apa penyebabnya, jika itu adalah infeksi peradangan maka perlu anti inflamasi, jika disebabkan oleh pencernaan yang buruk maka perlu diberikan untuk mengatur fungsi usus.