Pada prinsipnya, tidak ada kontraindikasi bagi penderita penyakit tangan, kaki dan mulut. Bila seseorang dengan HFMD tidak mengalami sakit tenggorokan, dia masih bisa mencerna semua makanan umum. Namun, sebagian besar anak-anak dengan HFMD mengalami sakit tenggorokan, jadi penting untuk menghindari makanan pedas dan mengiritasi, seperti cabai, atau camilan kering dengan banyak garam, yang dapat mengiritasi permukaan tenggorokan yang mengalami ulserasi ketika tertelan dan menyebabkan sakit tenggorokan. Sebagian besar anak-anak dengan HFMD tidak akan bisa makan makanan ini jika mereka mengalami sakit tenggorokan, jadi mereka harus makan makanan yang lebih ringan saat ini. Anak-anak dengan HFMD yang tidak memiliki gejala parah dan yang penekanan nafsu makannya tidak terlalu terasa, kemungkinan besar dapat makan ikan dan daging dalam jumlah besar dan memiliki nafsu makan yang besar. Namun, jika demam lebih terasa dan sedikit berpengaruh pada nafsu makan, maka kemungkinan besar ikan dan daging yang besar akan menambah beban pada saluran pencernaan anak dan menyebabkan gangguan pencernaan. Oleh karena itu, yang terbaik adalah makan makanan yang lebih mudah dicerna pada saat ini, dan kemudian membiarkan anak makan makanan yang lebih bergizi ini setelah kondisinya pulih sepenuhnya.