Prognosis kanker hipofaring buruk terutama karena: 1. daerah hipofaring kaya akan jaringan limfatik dan rentan terhadap metastasis kelenjar getah bening serviks bilateral; 2. lesi cenderung menyebar di sepanjang mukosa atau karakteristik infiltrasi submukosa, lesi sangat luas, cakupan lesi tumor yang sebenarnya sering kali melebihi apa yang terlihat pada pemeriksaan klinis tumor, beberapa lesi pasien dapat menginvasi nasofaring; 3. hipofaring terletak jauh ke dalam, gejala awal tidak khas, beberapa di antaranya hanya bermanifestasi sebagai sakit tenggorokan. Sangat mudah untuk salah mendiagnosis sebagai faringitis dan lesi terlambat terdeteksi; 4. Peluang pasien kanker hipofaring untuk mengembangkan tumor primer kedua pada saluran pencernaan/pernapasan bagian atas adalah 1/4 – 1/3; 5. Stadium lanjut lesi secara serius memengaruhi kualitas hidup pasien, dengan pengecilan, keganasan, dan penurunan kekebalan tubuh. Faktor-faktor yang mempengaruhi prognosis kanker hipofaring: 1, jenis kelamin dan usia: pasien wanita memiliki prognosis yang lebih baik daripada pria, dan pasien muda memiliki prognosis yang lebih baik daripada pasien tua. 2 . Lokasi tumor: prognosis karsinoma fosa berbentuk buah pir lebih baik daripada karsinoma daerah krikoid posterior dan daerah dinding faring posterior. 3 . Tumor primer: tingkat kontrol lokal dan tingkat kesembuhan menurun secara signifikan dengan meningkatnya stadium T. 4 . Metastasis kelenjar getah bening: tingkat kelangsungan hidup dengan metastasis kelenjar getah bening secara signifikan lebih rendah daripada tanpa metastasis kelenjar getah bening. 5. Tingkat diferensiasi sel tumor: tumor dengan diferensiasi rendah memiliki prognosis yang lebih baik dibandingkan tumor dengan diferensiasi baik, tetapi tumor dengan diferensiasi rendah memiliki insiden metastasis jauh yang lebih tinggi dibandingkan tumor dengan diferensiasi baik. 6. Faktor pengobatan: Pilihan pengobatan yang tepat memiliki dampak yang lebih besar pada prognosis. Untuk pasien radioterapi, dosis radioterapi berdampak pada tingkat kontrol lokal dan kelangsungan hidup secara keseluruhan.