Penyebab refluks asam antara lain sebagai berikut: Pertama, kebiasaan makan yang buruk, asupan zat asam dalam jumlah besar yang cenderung menyebabkan sekresi asam lambung yang berlebihan, atau tidak cukup berolahraga untuk meningkatkan gerak peristaltik setelah makan, atau bahkan langsung berbaring, dapat menyebabkan refluks isi lambung dan asam ke dalam esofagus. Kedua, adanya penyakit saluran pencernaan, termasuk esofagitis dan gastritis kronis, ulkus duodenum, tukak lambung, dan lain-lain, lesi ini cenderung menyebabkan fenomena refluks asam lambung. Pencernaan yang buruk dan gerakan peristaltik gastrointestinal yang lambat dapat menyebabkan sejumlah besar makanan tidak terurai sepenuhnya dan makanan tetap berada di lambung dan usus untuk waktu yang lama, sehingga mudah menyebabkan refluks asam.